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不论防控甲型H1N1流感偏重公共卫生还是基础科研，也不论流感防治重大专项如何立项，各受访人士均表示，国家防控资金的透明使用、公平竞争和合理分配都是重中之重

2009年5月20日，媒体报道甲型H1N1流感病毒在全世界确诊的感染者突破1万人。

与此同时，一场事关40亿元资金的防治流感重大国家专项的论证会也在北京某宾馆紧急进行中，专项何时发布，不得而知。

此前，国务院总理温家宝5月5日主持召开国务院常务会议，宣布将投入50亿元防控甲型H1N1流感，同时要求地方政府也要进行相应的资金投入。

如果按照通常的发达地区一比一匹配、欠发达地区由中央财政买单的原则，加上地方政府的投入，全国预防甲型H1N1流感的资金投入总数有望达到七八十亿元。

目前，《科学新闻》尚无法获知这次甲型H1N1流感防治专项经费分布的梗概，所咨询的大多数与流感病毒或者传染病防治相关的科研人员及其机构均不知道本领域相关经费的分配计划，也没有一个研究人员表示已经有研究经费到账。

但一位从事传染病研究的消息灵通人士透露，在50亿元流感防控资金中，国家将启动40亿元的重大专项。而该专项的具体分配，仍在论证过程中。