工作原理的不同
一般用于制作纯水的纯水发生器有两种：蒸馏水器和纯水机。纯水机又可分为普通纯水机和超纯水机两种。蒸馏水器和纯水机之间最大的区别在于制作纯水的原理不同，蒸馏水器靠蒸发再冷凝获得纯水，纯水机靠膜过滤获得纯水。
处理过后的水质不同
蒸馏水器出来的纯水通常称为蒸馏水。一般来说蒸馏水器单蒸的和双蒸的属于三级水，用于实验室器皿清洗，缓冲液配制等;三蒸水一般为二级水，可以做组织培养生化试验等。
纯水机产出的水一般叫纯水。反渗透纯水机产出的水可以替代单蒸或双蒸蒸馏水，都属三级水标准。超纯水机产出的水，水质覆盖二级一级标准。完全超越蒸馏水器的产水水质，还可以连续制水。
| 蒸馏水器 | 超纯水机 | |
| 水 质 | 无法有效去除各类杂质，电阻率,达不到兆欧级别。 | 18.25MΩ/CM 可无菌、无热源、超低TOC,持续获得超纯水。 |
| 产水能力 | 5-20L/H | 10-100L/H，产水效率更高 |
| 方便性 | 造水速度慢,有供水不及时的隐患。 | 随用随取,造水及时。全自动造水,一键式操作更简洁。 |
| 耗水比 | 1：18（冷却＋排放） | 1：3（浓缩水），更节约用水、环保、省钱。 |
| 电功率 | 4000-20000W | 50－100W，节省电费99％以上。 |
| 自动化 | 手动，需专人看管，存在共沸现象 | 全自动制水，更安全、可靠。无共沸现象。 |
| 维 护 | 易干烧，易结垢，难清洗，运行成本高，易中断使用 | 自动清洗功能，研发设计易于维护；运行成本低廉。 |
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