反渗透系统在正常运行一段时间后，反渗透膜元件会受到给水中可能存在的悬浮物质或难溶物质的污染，这些污染物中最常见的为碳酸钙垢、硫酸钙垢、金属氧化物垢、硅沉积物及有机或生物沉积物。污染物的性质及污染速度与给水条件有关，污染是慢慢发展的，如果不早期采取措施，污染将会在相对短的时间内损坏膜元件的性能。
定期检测系统整体性能是确认膜元件发生污染的一个好方法，不同的污染物会对膜元件性能造成不同程度的损害。当反渗透系统出现一下情况下时，应及时进行清洗：
1、系统的段间压差：一段压差≤0.2Mpa;二段压差≤0.1Mpa。
2、在系统运行参数不变的情况下，通过温度校正系统的产水量恢复设计产水量的85%以上。
3、产水脱盐率变化不超过5%
反渗透膜元件的常见污染物及其去除方法：
1、碳酸钙垢
在阻垢剂添加系统出现故障时或加酸系统出现而导致给水PH升高，那么碳酸钙就有可能沉积，出来，应尽早发现碳酸钙垢沉淀的发生，以防止生长的晶体对膜表面产生损伤，如早期发现碳酸钙垢，可以用降低给水PH至3.0～5.0之间运行1～2小时的方法去除。对沉淀时间更长的碳酸钙垢，则应采用柠檬酸清洗液进行循环清洗或通宵浸泡。
注：应确保任何清洗液的PH不要低于2.0，盃则可能会RO膜元件造成损害，特别是在温度较高时更应注意，最高的PH不应高于11.0。查使用氨水来提高PH，使用硫酸或盐酸来降低PH值。
2、硫酸钙垢
清洗液是将硫酸钙垢从反渗透膜表面去除掉的最佳方法。
3、金属氧化物垢
可以使用上面所述的去除碳酸钙垢的方法，很容易地去除沉积下来的氢氧化物(例如氢氧化铁)。
4、硅垢
对于不是与金属化物或有机物共生的硅垢，一般只有通过专业水处理的清洗方法才能将他们去除，有关的详细方法请与kertone水处理公司联系。
5、有机沉积物
有机沉积物(例如微生物粘泥或霉斑)可以使用清洗液3去除，为了防止再繁殖，可使用经认可的杀菌溶液在系统中循环、浸泡，一般需较长时间浸泡才能有效，如反渗透装置停用三天时，最好采用消毒处理，请与kertone水处理公司会商以确定适宜的杀菌剂。
6、清洗液
清洗反渗透膜元件时建议采用水处理专用的清洗液。确定清洗前对污染物进行化学分析十分重要的，对分析结果的详细分析比较，可保证选择最佳的清洗剂及清洗方法，应记录每次清洗时清洗方法及获得的清洗效果，为在特定给水条件下，找出最佳的清洗方法提供依据。
对于无机污染物、硫酸钙及有机物、以及严重有机物污染所使用的清洗液，所有清洗可以在最高温度为华氏104度(摄氏40℃)下清洗60分钟，所需用品量以每100加仑(379升)中加入量计，配制清洗液时按比例加入药品及清洗用水，应采用不含游离氯的反渗透产品水来配制溶液并混合均匀。
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